所谓的学校经营理念是教育观念依赖的概念。是校长关于如何办好学校的想法的总结。从某种意义上说，经营学校的想法是学校生存动机，生存势头和生存期望的有机组成部分。经营学校的概念是学校的灵魂，它包括这所学校的办学宗旨、办学目标、办学策略，具体体现在校训、校风、校规、校歌、教育理念、办学宗旨、育人取向、培养目标、精神偶像、育人途径、学风建设、教师形象、校园文化等许多方面。
安徽医科大学为省属重点大学，是教育部、国家卫健委和安徽省共建高校，安徽省第一批地方特色高水平大学，第一批综合改革试点学校。
学校前身是1926年创办于上海的私立东南医科大学，1930年更名为东南医学院，1949年底响应中共中央华东局“面向农村，走向内地”号召，内迁安徽怀远，成为安徽省第一所高等医科院校。1952 年迁址合肥，改名为安徽医学院。1985年更名为安徽医科大学。
学校将现代著名教育家蔡元培先生的题词“好学力行，造就良医”确立为校训，弘扬“爱国爱民，献身人类健康”的光荣传统，秉承“兴国、奉献、仁爱”的育人理念，倡导践行“求真、求精、求新”的优良学风，致力于建设高水平医科大学。
学校现有梅山路校区、翡翠路校区、东校区（在建）、巢湖临床医学院院区等4个主要校区，校园占地面积1820亩。有直属教学机构16个，直属附属医院6所（第一附属医院、第二附属医院、第四附属医院、附属巢湖医院、附属阜阳医院、安徽省口腔医院）。
现有在校全日制普通本科生11943人，全日制研究生3934人，留学生407人，成人本专科生（业余）17679人。在职教职医护员工11426人，其中校本部在职教职工1253人，专任教师702人，专任教师队伍中具有博士、硕士学位的教师占92%。
学校以医学为主，医学、理学、工学、管理学、法学等学科协调发展。设有临床医学（“5+3”一体化）等31个本科专业。拥有临床医学、药学、基础医学、公共卫生与预防医学4个博士学位授权一级学科点， 35个博士学位授权二级学科点；有13个硕士学位授权一级学科点，63个硕士学位授权二级学科点；拥有博士专业学位授予权学科1个，硕士专业学位授予权学科9个。临床医学、药理学和毒理学、分子生物学与遗传学3个学科进入ESI全球排名前1%。
建有药学、临床医学、公共卫生与预防医学3个博士后科研流动站。皮肤病与性病学为国家重点学科，中药药理学、中医肿瘤病学为国家中医药重点学科，有14个国家临床重点专科，5个省属公办普通本科高校一流学科奖补资金项目，其中临床医学、药理与毒理学获世界一流学科奖补资金项目，公共卫生与预防医学、药学、生物学获国内一流学科奖补资金项目。3个省级学科建设重大项目，18个省级重点学科。
建有2个教育部重点实验室， 25个省部级实验室，是国家药品临床研究基地。有1个教育部科技创新团队，2个安徽省科技创新团队，3个安徽省“115”产业创新团队，3个安徽省高校科研创新平台团队，1个安徽省高校智库。
