新疆医科大学在科学研究上，多年来新疆医科大学始终围绕新疆重大疾病、特高发疾病防治及区域特殊药物资源开发展开科学研究工作。在新疆少数民族特高发疾病学、中维西医结合学、包虫病学等特色学科上，取得了可喜的成绩，在国内外产生了一定的影响。在国家大幅压缩科研经费的情况下，学校科研项目和科研经费稳定增长，2016年获国家自然科学基金项目77项，省部级科研项目316项。
在医院建设和医疗服务上，学校临床教学及实习基地集中了全疆优质医疗资源，有6所直属附属医院，其中5所为三级甲等医院。在医院建设和医疗工作中，学校紧紧围绕新疆医疗卫生事业发展和各族人民健康需求，大力倡导以人为本、构建和谐医院的理念，推进医院的基础设施和内涵建设。
在大学文化建设上，学校形成了“以现代文化为引领，以社会主义核心价值体系建设为核心，遵循大学文化建设发展的客观规律，紧紧围绕并服务于建设教学研究型大学的奋斗目标，坚持以人为本，以德为先，以创建高水平文明单位和构建学习型高校为载体，以努力形成新医大人的共同愿景与共同价值观、增强学校核心竞争力为目标，大力弘扬爱国精神、科学精神、人文精神、医学职业精神和新医大精神，全面推进精神文化、制度文化、学术文化、物质环境文化和行为文化建设，努力形成促进和谐、激励创新、催人奋进的浓厚文化氛围，建成体现时代特征、地域特点和新医大特色的大学文化，为实现学校发展目标提供强大动力和可靠保证”的大学文化建设总体要求。各族师生互相平等、互相理解、互相尊重、互相信任、互相学习、互相帮助，使校园里展现出团结和谐、奋发向上的精神风貌，为维护新疆的社会安全稳定与团结和谐做出了积极的贡献。我校先后荣获全国医学教育系统卫生文化建设先进单位、思想政治工作先进单位、全国“高校校园文化建设优秀成果”三等奖等荣誉称号和奖项。
不断加强与国内外知名高校的交流合作。在教育部、国家卫生计生委、自治区人民政府的支持关心下，北京协和医学院、中南大学、吉林大学、北京中医药大学为我校全面对口支援大学，同时，我们与北京大学、复旦大学、中山大学、上海交通大学、上海中医药大学、中国药科大学、浙江大学、山东大学等20余所大学建立了长期的合作关系。在国外，与美、俄、日、英、法、德、巴基斯坦等多个国家大学及研究机构建立了校际合作关系。特别是近几年来，学校国际教育的规模和质量不断提升，学历被阿联酋、沙特、巴基斯坦等多个国家认可，学历教育人数包括博士、硕士、本科层次近600人，学校在周边国家的影响力不断增强，被教育部授予首批接受政府奖学金的高校、来华留学生教育先进集体。2011年，我校被批准成为自治区首批来疆留学高校示范基地。
