新疆维吾尔医学专科学校坚持以教师为本、以学生为本，不断强化教学中心地位，着力深化教育教学改革，狠抓内涵建设， 不断提高人才培养质量。高度重视构建校企结合、工学结合的人才培养模式，维医学专业形成“理实一体能力递进”人才培养模式，维药学形成了“一链、三段、五 模块”人才培养模式。近年来，建成了《维医内科学》、《维医生药学》2门自治区级精品课程。学校在2009年顺利通过教育部人才培养水平评估。
学校承担国家级、自治区级科研课题共19项，其中“爱维心口服液临床作用与产业化研究”课题于2009年荣获自治区科技进步奖。
为了更好地做好科学研究工作，学校成立了维医药研究所、维医药职业教育研究所和维医药文献研究所，积极争取承担国家级、自治区级科研课题。同时为了更好地打造学术研究交流平台，学校创办维医药学学术性刊物《新疆维吾尔医学专科学校学报》23年，共出版105期。
2010年维医药被定为国家级非物质文化遗产，学校被定为非物质文化遗产保护单位。整理、出版10余部古籍文献。编写出版了26种教材，形成了维吾尔医医、药学大专第二版教材体系，现与新疆医科大学合作编写维吾尔医医、药学本科教材。
占地总面积：1756000平方米（合2634亩），生均382.9平方米。其中，主校区100亩、分校区24亩，新校区1000亩，药材基地1280亩，直属医院30亩，直属药厂200亩。
建筑面积：校舍建筑面积89540平方米，其中教学行政用房26366平方米，生均5.75平方米。
教学仪器设备值：教学仪器设备总值2401.66万元，生均5236.93元。
图书资料：馆藏适用纸质图书10.18万册，生均22.19册。同时建有现代电子图书系统和计算机网络服务体系。实习、实训场所：建有12个基础实验室、直属医院、药厂、制剂室、药材种植基地等校内实训基地（其中生物制药实训基地被定为中央财政支持的示范性实训基地建设项目）。同时还与全疆30余家各级各类维吾尔医院、药厂等签约挂牌，构筑了校外实习、实训基地。
