南京大学医学院的前身是创办于1935年的中央大学医学院，1949年更名为南京南大学医学院，后来因为一些特殊原因在1951年的时候移交给了部队系统管理，1987年的时候经过教育部的批准重建成为了教育部第一所直属的综合性大学长学制医学院。
以南京鼓楼医院、南京军区南京总医院（金陵医院）和南京口腔医院作为附属医院，并以南京市各专科医院作为教学医院，师资力量雄厚，现有中国工程院院士2人，博士生导师105人，教授116人，副教授150人。近三年获国家科技进步一等奖1项、二等奖1项，获教育部高等学校科技进步一等奖5项、二等奖2项。近三年获国家重大科研项目8项，国家自然科学基金204项，总累计科研经费约1.7亿元。
招生计划
1、结合我校“三三制”人才培养方案，经教育部批准，2017年我校实行按专业和学科大类相结合的招生模式，计划面向全国招收全日制普通本科生3300人。
2、根据国家和教育部相关文件精神，结合学校人才培养目标、办学条件等实际情况，我校统筹考虑各省（自治区、直辖市）考生人数、生源质量、区域协调发展，以及历年计划延续性等因素，分省确定招生计划，报教育部审批后由各省级招生主管部门向社会公布。
3、根据教育部相关文件精神，我校按学校年度本科招生计划总数的1%制定预留计划，用于调节各地统招上线生源的不平衡。
录取规则
4、我校本科招生录取工作遵循教育部规定的“学校负责、招办监督”的录取体制，在教育部领导下，由各省（自治区、直辖市）招生主管部门统一组织进行。
5、我校按照理工类、文史类和艺术类分类录取考生。对于实行高考综合改革的上海市、浙江省，录取时按照当地招生主管部门政策执行。
6、我校本科招生实行远程网上录取。根据各省（自治区、直辖市）考生报考情况确定调档比例或调档分数。实行平行志愿投档的省份，调档比例原则上控制在105%以内。 第十五条 我校本科招生实行按志愿录取。若批次投档完成生源不足，剩余计划公开征集，征集后仍未完成的计划调至生源充足的省份。
7、我校对进档考生按分数优先的原则依据实考分安排录取专业，不设专业级差。实考分相同时，按所在省（自治区、直辖市）招生主管部门提供的投档位次录取。未提供投档位次的，文史类考生依次比较语文、英语、数学成绩，理工类考生依次比较数学、语文、英语成绩，综合改革类考生依次比较数学、语文、英语成绩。
8、我校原则上承认各省（自治区、直辖市）招生主管部门根据教育部相关政策给予考生的全国性高考加分项目；同一考生如有多项政策性加分，只取其中最高一项分值，且加分不得超过20分。符合教育部规定的具有加分条件的考生，按照加分后的成绩调档，进档后扣除加分参与专业排序。
9、我校自主招生、综合评价、高水平艺术团、高水平运动队、艺术类专业等录取办法依据教育部、对应省（自治区、直辖市）招生主管部门规定、我校本年度相关类别招生简章、考生与学校签订的协议执行。
我校保送生、面向农村及贫困地区的国家专项计划和高校专项计划（即励学计划）、少数民族班（新疆）、内地新疆班、内地西藏班、华侨和港澳台地区学生的录取按照教育部相关规定及我校有关招生办法执行。
第十九条 我校各专业（专业类）的录取不规定男女生比例，不限制外语语种。入学后除外国语言文学类专业外，其他专业学生均需通过教学计划规定的英语课程和学位英语考试。
10、我校对于江苏省考生还执行以下规定：高中学业水平测试两门选测科目等级最低要求为AA，必测科目等级及综合素质评价必须达到江苏省规定的填报本科院校志愿的要求；若考生两门选测科目等级均达到A+则加3分参与专业排序；高水平艺术团优录考生两门选测科目等级最低要求为BB；高水平运动队、艺术类考生的学业水平测试等级要求按江苏省有关规定执行；自主招生（含励学计划）和综合评价录取考生两门选测科目等级最低要求为AA。
11、我校对于高考综合改革试点省份学生综合素质档案材料的使用办法为：在特殊类型招生中，综合素质档案材料将作为报名资格审核的参考；在普通高考录取中，综合素质档案材料将作为调剂考生专业志愿的参考。
