从教育部官网获悉，截至2016年7月9日，全国高等学校(不含独立学院)共计2542所，其中：普通高等学校2246所(包括民办普通高校444所);成人高等学校296所(包括民办成人高校1所)。从公布的名单中看到，新疆共有39所，具体名单如下表：
新疆维吾尔自治区（39所） | |||||
| 1 | 新疆大学 | 新疆维吾尔自治区 | 乌鲁木齐市 | 本科 | |
| 2 | 塔里木大学 | 新疆生产建设兵团 | 阿拉尔市 | 本科 | |
| 3 | 新疆农业大学 | 新疆维吾尔自治区 | 乌鲁木齐市 | 本科 | |
| 4 | 石河子大学 | 新疆生产建设兵团 | 石河子市 | 本科 | |
| 5 | 新疆医科大学 | 新疆维吾尔自治区 | 乌鲁木齐市 | 本科 | |
| 6 | 新疆师范大学 | 新疆维吾尔自治区 | 乌鲁木齐市 | 本科 | |
| 7 | 喀什师范学院 | 新疆维吾尔自治区 | 喀什地区 | 本科 | |
| 8 | 伊犁师范学院 | 新疆维吾尔自治区 | 伊犁州 | 本科 | |
| 9 | 新疆财经大学 | 新疆维吾尔自治区 | 乌鲁木齐市 | 本科 | |
| 10 | 新疆艺术学院 | 新疆维吾尔自治区 | 乌鲁木齐市 | 本科 | |
| 11 | 新疆工程学院 | 新疆维吾尔自治区 | 乌鲁木齐市 | 本科 | |
| 12 | 昌吉学院 | 新疆维吾尔自治区 | 昌吉州 | 本科 | |
| 13 | 新疆警察学院 | 新疆维吾尔自治区 | 乌鲁木齐市 | 本科 | |
| 14 | 和田师范专科学校 | 新疆维吾尔自治区 | 和田地区 | 专科 | |
| 15 | 新疆农业职业技术学院 | 新疆维吾尔自治区 | 昌吉州 | 专科 | |
| 16 | 乌鲁木齐职业大学 | 新疆维吾尔自治区 | 乌鲁木齐市 | 专科 | |
| 17 | 新疆维吾尔医学专科学校 | 新疆维吾尔自治区 | 和田地区 | 专科 | |
| 18 | 克拉玛依职业技术学院 | 新疆维吾尔自治区 | 克拉玛依市 | 专科 | |
| 19 | 新疆机电职业技术学院 | 新疆维吾尔自治区 | 乌鲁木齐市 | 专科 | |
| 20 | 新疆轻工职业技术学院 | 新疆维吾尔自治区 | 乌鲁木齐市 | 专科 | |
| 21 | 新疆能源职业技术学院 | 新疆维吾尔自治区教育厅 | 乌鲁木齐市 | 专科 | 民办 |
| 22 | 昌吉职业技术学院 | 新疆维吾尔自治区 | 昌吉州 | 专科 | |
| 23 | 伊犁职业技术学院 | 新疆维吾尔自治区 | 伊犁州 | 专科 | |
| 24 | 阿克苏职业技术学院 | 新疆维吾尔自治区 | 阿克苏地区 | 专科 | |
| 25 | 巴音郭楞职业技术学院 | 新疆维吾尔自治区 | 巴音郭楞州 | 专科 | |
| 26 | 新疆建设职业技术学院 | 新疆维吾尔自治区 | 乌鲁木齐市 | 专科 | |
| 27 | 新疆兵团警官高等专科学校 | 新疆生产建设兵团 | 乌鲁木齐市 | 专科 | |
| 28 | 新疆现代职业技术学院 | 新疆维吾尔自治区教育厅 | 乌鲁木齐市 | 专科 | 民办 |
| 29 | 新疆天山职业技术学院 | 新疆维吾尔自治区教育厅 | 乌鲁木齐市 | 专科 | 民办 |
| 30 | 新疆交通职业技术学院 | 新疆维吾尔自治区 | 乌鲁木齐市 | 专科 | |
| 31 | 新疆石河子职业技术学院 | 新疆生产建设兵团 | 石河子市 | 专科 | |
| 32 | 新疆职业大学 | 新疆维吾尔自治区 | 乌鲁木齐市 | 专科 | |
| 33 | 新疆体育职业技术学院 | 新疆维吾尔自治区 | 乌鲁木齐市 | 专科 | |
| 34 | 新疆应用职业技术学院 | 新疆维吾尔自治区 | 伊犁州 | 专科 | |
| 35 | 新疆师范高等专科学校 | 新疆维吾尔自治区 | 乌鲁木齐市 | 专科 | |
| 36 | 新疆铁道职业技术学院 | 新疆维吾尔自治区 | 乌鲁木齐市 | 专科 | |
| 37 | 新疆生产建设兵团兴新职业技术学院 | 新疆生产建设兵团 | 乌鲁木齐市 | 专科 | |
| 38 | 哈密职业技术学院 | 新疆维吾尔自治区 | 哈密市 | 专科 | |
| 39 | 新疆科技职业技术学院 | 新疆维吾尔自治区教育厅 | 乌鲁木齐市 | 专科 | 民办 |
